Οι ρίζες της δημιουργίας του Δημοτικού Βρεφοκομείου ξεκινούν από την επιθυμία και το κληροδότημα του ομογενή ευεργέτη Αντωνίου Νινή, ο οποίος περί το έτος 1840 θέλησε να δημιουργηθεί ένα φορέα περίθαλψης απροστάτευτων βρεφών στην πατρίδα του τη Θεσσαλονίκη. Το Βρεφοκομείο λειτούργησε στο πλαίσιο της Ελληνικής ορθόδοξης Κοινότητας της Θεσσαλονίκης έως το έτος 1912, στη συνέχεια εντάχθηκε ως «αυτοτελές και ανεξάρτητο κοινοτικό κατάστημα» στο Ελληνικό κράτος, ενώ από το 1938 τη συντήρηση του ανέλαβε εξ ολοκλήρου ο Δήμος Θεσσαλονίκης. Τη συγκεκριμένη χρονική στιγμή μεταλλάσσεται ουσιαστικά ο φιλανθρωπικός χαρακτήρας του σε προνοιακό θεσμό της τοπικής αυτοδιοίκησης. Το τμήμα λειτουργεί σε 24ωρη βάση (βάρδιες) Σαββατοκύριακα και γιορτές (όλες τις ημέρες του χρόνου ανεξαιρέτως). Στο τμήμα περίθαλψης βρεφών - Βρεφοκομείο γίνονται δεκτά βρέφη και νήπια από τον πρώτο μήνα της ζωής τους έως την ηλικία των 2,5 ετών. Κατ’ εξαίρεση και εφόσον κριθεί αναγκαίο γίνονται δεκτά νήπια ηλικίας έως 4 ετών. Το Τμήμα Περίθαλψης Βρεφών εποπτεύεται από Προϊσταμένη, υπάλληλο του Δημοτικού Ιδρύματος. Στόχος του «Αγίου Στυλιανού» είναι να παρέχει αγάπη, φροντίδα και περίθαλψη στα παιδιά που του εμπιστεύονται έως ότου γίνει δυνατή η επανένταξη στο οικογενειακό τους περιβάλλον, με απόλυτο σεβασμό στην προσωπικότητα και τα δικαιώματα τους. Στις περιπτώσεις που είναι ανέφικτο προχωρούμε στη αποκατάσταση τους σε θετές ή ανάδοχες οικογένειες. Λειτουργεί Βρεφονηπιακός Σταθμός για τα παιδιά του Βρεφοκομείου αλλά και των δημοτών.